أهم المميزات الجديدة في iPhone 3Gs:
- توفر الآيفون الجديد iPhone 3GS بسعتين الآن 32 جيجابايت و 16 جيجابايت أبيض وأسود كما لن يتوقف بيع آيفون 3G القديم لكنه سيتوفر بسعة 8 جيجابايت فقط باللون الأسود.
- سرعة مضاعفة للجهاز حيث يتم تصفح الإنترنت وتشغيل البرامج والألعاب أسرع بمرتين، ومع قوة أكبر لقدرات الجهاز الثلاثية الأبعاد تكون الألعاب أكثر متعة وتشتغل بسلاسة أكبر.
- تصوير الفيديو 30fps عمودي أو أفقي، وتعديله بقص الأجزاء الإضافية في البداية والنهاية، ثم يمكن رفعه مباشرة على يوتيوب أو إرساله بالإيميل، كما يمكن نسخ مقاطع الفيديو ومزامنتها مع جهاز الكمبيوتر عبر iTunes.   
- كاميرا 3 ميجا بكسل متطورة مع auto-focus لتعديل تركيز الصورة تلقائيًا أو يدويًا / وضعية macro لتصوير الأشياء القريبة / وضعية low-light للتصوير في الأماكن المظلمة / تعديل ألوان التصوير تلقائيًا / تصوير سريع جدًا للقطات متتابعة.
- التحكم الصوتي: اضغط باستمرار على زر Home ثم تقول الاسم ليتم الاتصال كما يمكنك أن تملي رقم التلفون على الآيفون ليقوم بالاتصال عنك أو تقول اسم القارئ، المنشد، أو المغني ليتم تشغيل برنامج الآيبود فورًا.
- بوصلة رقمية تقوم البوصلة بحساب اتجاهك ليتم تدوير الخرائط تباعًا.
- الملاحظات الصوتية حيث يتيح لك البرنامج تسجيل الصوت وإرساله بالإيميل أو عبر الـ MMS بسهولة تامة كما يمكن نسخ ومزامنة الملاحظات والمقاطع الصوتية إلى جهاز الكمبيوتر عبر iTunes.
- مشاركة الإنترنت عبر البلوتوث أو سلك الـ USB حيث يمكنك الاستفادة من الإنترنت 3G على الآيفون لإيصال الإنترنت لجهاز الكمبيوتر أينما كنت.
- بطارية أفضل لتدوم ساعات أطول.
- رسائل نصية / رسائل وسائط.